Die Wetterfahne des ersten Kirchengebäudes in Braunlage stammt aus dem Jahr 1652 und weist damit in die Anfänge der Siedlung an der Warmen Bode zurück.

Sie ist einer der ältesten erhaltenen Gegenstände aus dem Braunlage Tal überhaupt.

Die Kirche selbst wurde bereits 1602 gebaut. Sie befand sich von einem Friedhof umgeben gegenüber dem Pfarrhaus der heutigen St. Trinitatiskirche in der Ortsmitte – dort wo noch heute das ehemalige Postgebäude steht.

1657 wurde sie erweitert, 1697 erhielt sie eine dritte Glocke und vermutlich wurde im gleichen Jahr ein Turm neben der Kirche errichtet.

1708 entstand unter Pfarrer Wiedemann das Pfarrhaus, das heute noch hinter der St. Trinitatis-Kirche steht.